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Trabalha para prevenir e controlar doenças como raiva, dengue, Zika, chikungunya e doença de chagas. Também realiza o controle de animais domésticos (cães e, gatos). Controla ainda os chamados animais sinantrópicos: morcegos, pombos, ratos, mosquitos, abelhas e outros.
Todo esse trabalho é feito por meio de ações educativas, embora também possa atuar para o cumprimento da lei, fiscalizando e multando, quando necessário.
Os agentes de controle de endemia – ACEs -  realizam arrastões nos bairros para a retirada de criadouros de mosquitos e desenvolve ações de educação e mobilização social com o objetivo de combater o Aedes, mosquito selvagem transmissor da dengue, Zika e chikungunya.