A Vigilância Epidemiológica é a unidade responsável por um conjunto de ações que proporcionam o conhecimento, a detecção ou prevenção de qualquer mudança nos fatores de saúde individual ou coletiva, com objetivo de recomendar e adotar as medidas de prevenção e controle das doenças ou agravos.
Realiza a investigação dos casos de doenças e agravos de notificação compulsória, realiza a notificação nos sistemas de informação oficiais, coordena e orienta medidas de controle, elabora e atualiza protocolos e fluxo dos agravos de notificação compulsória entre outras atividades.
Gerencia os sistemas de informação (SIM/SINASC), realiza a vigilância dos óbitos sentinela para planejamento das ações e políticas públicas, emite relatórios periódicos pactuados, entre outras atribuições.